第三代试管婴儿与一般试管婴儿相比，增加了遗传诊断这一步。一般包括以下步骤：
1.促排卵；
2.取卵；
3.ICSI授精；
4.囊胚培养（5天时间)；
5.囊胚活检（取滋养外胚层3-10个细胞进行遗传学诊断)；
6.囊胚冷冻；
7.植入前诊断，筛选正常胚胎（主要是应用基因芯片技术对胚胎染色体结构异常及数目异常进行诊断；或者应用基因芯片技术和高通量测序技术对单基因疾病进行诊断；或者用FISH技术对部分染色体数目进行诊断)，准确性95%，有假阳性与假阴性可能性，需经过产前诊断才能确诊；
8.正常囊胚复苏移植；
9.妊娠诊断；
10.产前诊断，即怀孕早期进行绒毛活检或者怀孕中期进行羊水穿刺检查胎儿染色体或基因。经产前诊断异常的仍可能面临流产或引产。
总的来说，第三代试管婴儿的目的是在还没有形成胎儿之前就进行遗传性诊断，极大降低流产和出生缺陷风险。
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