水煮奶瓶消毒器：水煮奶瓶消毒器其实是传统的消毒方法，其原理是将水煮沸到100摄氏度，通过高温来消毒奶瓶。这种消毒方法适宜消毒耐高温120摄氏度以上的器皿。配备的奶瓶盛放篮，可盛放6只左右的奶瓶。
蒸汽奶瓶消毒器：采用100摄氏度的高温蒸汽消毒，是目前使用最广泛，消毒效果最彻底、有效的方法，国家餐具消毒标准采纳了这种方法，医疗器具的消毒标准是在餐具消毒标准基础上提高了消毒环境的压力和温度。这类消毒器对于待消毒器具的结构、透光性没有苛刻的要求，尤为适合消毒小孩的奶瓶、餐具。
烘干奶瓶消毒器：采用蒸汽消毒法消毒完的奶瓶，奶瓶壁会附上大量水珠，潮湿的环境容易造成细菌繁殖，为了提高奶瓶的保洁时间，这类产品在普通蒸汽奶瓶消毒器的基础上增加了烘干功能，也就是常说的烘干奶瓶消毒器，这类带烘干功能的奶瓶消毒器，其烘干方式分为两种：一种是从外部抽入空气吹干奶瓶；另一种是采用内部热涡流来烘干，无需抽入外部空气来吹干奶瓶。
微波炉奶瓶消毒器：实质是一个盛放奶瓶的塑料器具，本身并不具有消毒功能，也称奶瓶消毒盒。其工作原理是用微波炉发出的微波，加热奶瓶消毒盒内的水，使其成为高温蒸汽，消毒奶瓶消毒盒内的奶瓶。
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