打乙脑疫苗后发烧通常来说是一种正常的免疫反应，但是家长还是不能掉以轻心的，有些宝宝会出现疫苗接种后的不良反应，甚至引起不可逆转的疾病。
预防注射所用的疫苗主要有三种成份：免疫抗原、溶液以及佐剂。
免疫抗原有些只含单种且纯粹的多糖蛋白质或类毒素(如白喉、破伤风疫苗)，有些却含复杂的整株活病毒(如麻疹、德国麻疹、腮腺炎、口服小儿麻痹疫苗﹞或死菌(如百日咳疫苗)。
搭配疫苗的溶液可为单纯的蒸馏水、食盐水，也可以是含比较复杂成份的组织培养液，其中可能含有一些蛋白质、鸡蛋白抗原或其他种类的动物织(如日本脑炎疫苗)等，另外还有少量的防腐剂、抗生素、安定剂常被加入其中，以防止疫苗受到污染以及安定抗原之用。
佐剂是用来加强及延长疫苗的抗原性以及免疫效益的(如三合一疫苗)。注射疫苗以后的不良反应可能和这三样成份都有关系。
几乎所有的疫苗都可引起发烧的反应。其中以三合一疫苗最为常见，约有一半以上的幼儿会有发烧的现象，多半是在一天以内发生，且很少持续二天以上的。麻疹疫苗的发烧则要在接种后五至十天才发生。
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